Während des Vietnamkriegs erhält Captain Willard einen Sonderauftrag: Er soll den desertierten Colonel Kurtz aufspüren und liquidieren. Angeblich hält dieser sich mit seiner Einheit im kambodschanischen Dschungel verborgen.
An Bord eines Patrouillenboots machen sich Willard und seine Leute dorthin auf.
Am Ende ihrer Odyssee erreichen sie das Einflussgebiet des wahnsinnig gewordenen Elite-Offiziers Kurtz, der alle Regeln der Zivilisation außer Kraft gesetzt hat.
Mit „Apocalypse now final cut“, vermittelt Coppola einen realistischen Eindruck von diesem moralisch sehr zweifelhaften Krieg, den die USA in Südostasien führten.
